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CLI 参考

首选公开命令为:

hemispec

以下子命令已于 2026-09-05 与当前工具包接口核对。如果工具包源码或包名发生变化,请在公开发布前重新核对。

当前子命令

hemispec quickstart      运行公开安全的合成测试
hemispec models          列出或预下载已发布的训练 DGN 模型包
hemispec infer           在预处理 GM 图上运行训练好的 DGN 推理
hemispec compute         从实际和重建 GM 图计算 ANS/RNS 图
hemispec run             运行 DGN 推理然后进行 ANS/RNS 计算
hemispec workflow        运行双向 DGN 并生成 ANS/RNS 输出
hemispec trt             测试-重测可靠性验证
hemispec specificity     结构特异性验证
hemispec hemi-classify   ROI 级半球分类器验证

命令命名

命令行界面使用 hemispec,图形界面使用 hemispec-gui。

模型资产预取

当前 main 可预下载 Git LFS 追踪的 DGN 检查点:

hemispec models --install

如果跳过此步骤,workflow、infer、run 和 GUI 会在首次使用模型时从仓库 main 分支的 Git LFS media 下载 DGN 检查点。

CLI 仍支持 --with-classifier,但目前不应将其作为可用的安装方法,因为必需的 feature_names.csv media URL 返回 HTTP 404。请从本地 Git LFS 检出使用分类器资产,并通过 --classifier-model-dir 或 HEMISPEC_CLASSIFIER_MODEL_DIR 指定;详见数据与模型中的已知限制。

ROI 输出

ROI 导出目前通过 compute、run 和 workflow 上的选项暴露。对于 workflow,ROI 导出是可选的,可用 --no-roi-table 跳过;分类器验证通过 --run-classifier 选择启用,且需要 ROI 特征。

--roi-atlas
--roi-out-csv
--roi-label-table
--roi-stat
--no-roi-table
--run-classifier

目前还没有独立的 roi 子命令。

已发布分类器只接受来自兼容 Glasser 1.5 mm atlas 的特征:左侧同源标签为 1..180,右侧为 1001..1180。自定义 atlas 可用于 ROI 导出,但不能与已发布分类器配合使用。

报告

目前还没有独立的 report 子命令。报告应被视为计划中的功能,直到实现为止。

ANS/RNS 与跨半球 DGN 框架源自 Wang 等人(2024),详见引用。